NEARは他の国際機関とともに交流を活性化し、共同事業の推進を通じて北東アジアを越えて全世界の地域とのコミュニケーションが可能な国際協力ネットワークの構築に努めている。
・ AER(欧州地域会議)とパートナー協定を締結(2012年10月12日MOU締結)
AER(Assembly of European Regions、欧州地域会議)は、ヨーロッパ地域自治体の共同繁栄及び補完性(中央政府は、地方政府が効率的に機能できない場合、サポートするという原則)を追求するために1985年に設立された機関であり、現在27カ国134の自治体で構成されている。事務局は、フランスのアルザス州ストラスブールに所在している。

・ ロシア科学アカデミー傘下東方学研究所とパートナーシップを構築(2013.2.21 MOU締結)
ロシア科学アカデミー傘下東方学研究所は、1818年に設立されたロシア国家政策研究機関であり、国立大学院として主に東洋学や北アフリカ西部海岸から太平洋地域を研究している。近年は、外交問題から経済、社会問題にいたるまで研究分野を拡大している。9つの学術センターと11の学部を運営している。

・ R20(気候行動地域)とパートナーシップを構築(2014年8月28日MOU締結)
R20(Regions of Climate Action、気候行動地域)は、2011年、アーノルド・シュワルツェネッガー前カリフォルニア州知事をはじめ、世界の指導者が国連と協力して設立した機関である。この機関は、世界の各州、地方、地域およびその他の国家政府が気候変動に対する弾力性を備えた低炭素経済発展プロジェクト、政策、優秀事例の開発・施行・普及を目的とする。本部はスイスのジュネーブに所在している。

・ ICLEI(持続可能性な都市と地域をめざす自治体協議会)とパートナーシップを構築(2016. 6. 16 MOU締結)
ICLEI(International Council for Local Environmental Initiatives)は、持続可能な発展に向けて努力する都市と地方自治体のグローバルネットワークで、世界86ヶ国、約1,000余りの地方自治体が会員となっている。国際社会における持続可能な発展目標を達成するための地方自治体の役割の重要性と地域単位の実践の必要性を強調している。本部はドイツのボンに所在し、東アジア本部が大韓民国のソウルに置かれている。

・ 黒竜江省社会科学院とパートナーシップを構築（2017.6.15 MOU締結)
黒竜江省社会科学院は、1979年に設立された中国黒竜江省の主要シンクタンクであり、社会科学分野の総合国立研究機関かつ国立大学院である。2018年には黒竜江省発展研究センター及び黒竜江省民族研究所を統合し、研究領域を拡大した。主な研究分野としては、国内外における政治、経済、法学、歴史などであり、14の研究所と8つの学部、1つの学術誌出版機関を運営している。

会員自治体パートナー（連合支援機関）

• ・ 新潟県 : （公財）環日本海経済研究所（ERINA）、NPO法人新潟県対外科学技術交流協会
• ・ 富山県 : （公財）環日本海環境協力センター（NPEC）、国立大学法人富山大学極東地域研究センター、（公財）とやま国際センター(TIC)
• ・ 石川県 : 日本国際連合協会石川支部、北陸環日本海経済交流促進協議会
• ・ 兵庫県 : （公財）ひょうご震災記念21世紀研究機構
• ・ 韓国 慶尚北道 : 大邱慶北研究院
• ・ 韓国 忠清北道 : 忠北研究院
• ・ 韓国 慶尚南道 : 慶南研究院
• ・ ロシア　ハバロフスク地方 : ロシア科学アカデミー極東支部経済研究所