全体会议

全体会议是会员地方政府行政首长组成的最高决策机构，隔年召开一次。全体会议具有以下职能：

• 决定会员及准会员的入会及除名
• 决定会费事宜
• 修改联合会宪章
• 决定机构的解放和清算事宜
• 决定秘书处的设置地点
• 选举监事
• 批准预决算及项目计划
• 批准会费运营规定中所规定事项
• 决定召开下一届全体会议的有关事项
• 决定并执行联合会的各项工作计划
• 决定其他必要的事项 

历任主席

• 第一任（1996年9月至1998年10月）:庆尚北道知事 李义根
• 第 2 任 (1998年10月至2000年9月) :富山县知事 中冲丰
• 第 3 任 (2000年 9月至 2002 年9月) :兵库县知事 井户敏三
• 第 4 任 (2002年 9月至 2002 年9月) :哈巴罗夫斯克边疆区区长 伊沙耶夫
• 第 5 任 (2002年 9月至 2004 年9月) :黑龙江省省长 张左己
• 第 6 任 (2004年 9月至 2006年 9月) :釜山广域市市长 许南植
• 第 7 任(2006年 9月至 2008年 9月) :山东省省长 韩寓群、姜大明
• 第 8 任 (2008年 9月至 2010年10月):京畿道知事 金文洙
• 第 9 任 (2010年10月至2012年7月):宁夏回族自治区主席 王正伟
• 第10 任（2012年7月至2014年6月）：全罗南道知事 朴晙莹（2014年7月至2014年10月）全罗南道知事 李洛渊
• 第11 任（2014年11月至2015年9月:伊尔库茨克州州长 叶罗先科
              （2015年10月至2016年9月) :伊尔库茨克州州长  莱夫琴科谢尔盖
• 第12 任（2016年11月至2018年10月）：湖南省省长 许达哲
• 第13 任（2018年11月至2021年8月）：萨哈共和国 艾森尼古拉耶夫行政长官
• 第14任主席(2021.08 ~ 2023.10) ：蔚山广域市金斗谦市长
• 第15任主席(2023.10 ~ 现在) ：中国辽宁省李乐成省长

事务委员会

事务委员会由各会员地方政府首脑任命的厅(局)长级干部组成。事务委员会主任(委员长)由主席国地方政府副职担任，会议于全体大会前一年召开。事务委员会的职能如下

• 讨论实业计划和有关单列项目事宜
• 编制年度报告和会计报告
• 协调会员地方政府之间的意见
• 决定成立专门委员会（组成、职能、运作方法等）有关事宜
• 受全体会议的委托，决定相关事项
• 其他必要事项

专门委员会

专门委员会由该专门委员会所负责领域的会员地方政府相关领域的课长级工作人员组成,根据需要举行会议。